如何用“生命之树”揭示植物病原体的秘密？
2024-06-24 13:54:13 发布
北卡罗来纳州立大学的科学家们开创了先河，开发了全球首个在线工具，专门用于识别和监测疫霉属——一种对植物构成严重威胁的病原体。这种病原体曾引发19世纪40年代的爱尔兰马铃薯饥荒，并正在美国西海岸引发橡树的群体性死亡。研究成果已发表在《公共科学图书馆·综合》杂志上。
疫霉属自1876年首次被描述以来，已发现超过150个新物种，它们广泛存在于空气、土壤和水中，对粮食作物、观赏植物和树木的健康构成威胁。这个“生命之树”项目不仅提供了192个已正式描述的疫霉属物种的详细信息，包括它们的进化历史和群体关系，还涵盖了30多个非正式描述的分类单元。此外，项目还整合了基因序列数据和每个物种的全球分布、宿主植物以及病原体在宿主上的位置信息。
这个基于树的比对选择器（T-BAS）工具包，将所有已知的疫霉属物种纳入一个动态的“生命之树”中，允许研究人员实时更新植物病害信息，并将新出现的威胁物种纳入开放获取的数据库中。通过这种方式，研究人员可以监测哪些群体正在扩大和进化，从而在疾病暴发前捕捉到关键信号。
虽然植物病原体对普通人来说可能显得陌生和沉默，但它们通过广泛的宿主范围在植物间传播，具有极大的破坏力。这个新工具的出现，不仅让看似微不足道的威胁显现出来，还为科研人员提供了判断其潜在危机并及时应对的手段。